מחלקות בעלי החיים בגן כוללות:
- זוחלים – מרבית מיני הזוחלים נמצאים בתצוגת הזוחלים שבבניין המרכזי בגן החיות וכוללת מיני נחשים מישראל ומהעולם, לטאות צבים ותנין, אבל עוד מספר מיני זוחלים, בעיקר צבים, נמצאים בתצוגות אחרות ברחבי גן החיות.
- בעלי כנף – בגן החיות כולל אוסף הציפורים פינגווינים, פלמינגו, עופות דורסים (דורסי יום ודורסי לילה), מגוון תוכים ועוד.
- יונקים – בגן מגוון של מיני קופים, כולל ארבעה מיני למור ממדגסקר, קופי גונון, בבונים וקופים קטנים יותר מדרום-אמריקה. בנוסף לקופים יש מגוון מיני טורפים, כולל טיגריס בנגלי, שועל, דובים, לוטרות, גירית דבש, ועוד, מספר מיני מכרסמים, כולל הקפיבארה, המכרסם הגדול בעולם, וכן קנגורו, גמל ועטלף-ענק.
שימו לב שחלק מהחיות עשויות להיות לא פעילות בזמן ביקורכם ואולי יהיה קשה לראותן וחלק נמצאות מאחורי הקלעים ואינן מוצגות למבקרים.