מחלקות בעלי החיים בגן כוללות:
- זוחליה (הנמצאת בבניין המכון הביולוגי)– תצוגת הזוחלים כוללת עשרות מיני נחשים מישראל ומהעולם, ומספר מיני לטאות וצבים.
- בעלי כנף – אוסף של בעלי כנף מים וביצה, עופות דורסים (דורסי יום ודורסי לילה), תוכים וציפורי שיר.
- יונקים – קופים: בגן החיות ישנה משפחה גדולה של בבון מצרים ומשפחה של גנון דה בראזה מאפריקה, קפוצ'ינים מאמריקה הדרומית ולמורים ממדגסקר.
שילוט מיוחד מספר על אמצעי התקשורת ועל ארגון חברתי בקופים.
טורפים: הגדול שבטורפים שבגן החיות הוא הטיגריס הבנגלי . בגן נמצאים גם נמר, קרקל, זאב, תן, צבוע, שועלים, אריות, דובים, לוטרות ועוד.
אוכלי עשב: יעלים , גמל , חזיר בר וחיות משק.
- דו חיים ודגים